J'attends toujours que vous définissiez ce que vous entendez par réfléchir. Comme pour "évolution", vous utilisez ce terme dans au moins deux acceptions différentes, consciente ou non. Et c'est pourquoi je trouve votre problématique mal posée, depuis le début.
Comme Stéphane l'a mentionné, tout ce que l'on sait avec certitude c'est que le cerveau est absolument nécessaire pour que l'on "produise" ces émotions. On a aussi besoin de notre cerveau pour jouer de la musique, ou toute autre activité de création. Le problème avec votre théorie n'est pas à ce niveau. Ce que vous pensez, c'est que lorsqu'on est pas conscient d'une activité cérébrale on ne réfléchit pas mais c'est l'âme qui s'exprime. C'est à vous de le prouver.
Pour des références sur le rôle du cerveau dans l'émergence des émotions et de la conscience, vous pouvez toujours lire les ouvrages d'Antonio Damasio... Quoique, s'ils vous marquent autant que le texte de Bouveresse, vous risquez de ne pas vous en sortir.
Jean-François