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Vous êtes menteur ou quoi?


R: Un problème mathématique n'est pas forcément un modèle représentatif -- Jean-Francois
Posté par Julien , Jan 23,2003,10:00 Index  Forum

« « Proposez-moi une démonstration empirique, si vous voulez une contre-argumentation empirique »

Vous êtes un menteur alors ? J’ai fais ce que vous avez demandé et votre réponse n’atteint AUCUN point de ma démonstration.

« Non, ce n'est pas empirique. »

C’est quoi votre problème ?

Dites-moi ce qui n’est pas empirique dans :

« Un gène de 1000 bases, 4 choix par emplacement ça fait combien de séquences Rodrigue? 4E1000 ou 10E602. »

Où est le problème? .. les probabilités n’existent plus dans votre p’tit monde imaginaire ?

2e étape : Relisez

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Effectivement, le nombre de séquences utiles est fixé arbitrairement. La question qui se pose est la suivante : (si vous êtes vraiment un scientifique, je me demande pourquoi vous n’y pensez pas et pourquoi je dois vous prendre par la main) :

Q : Est-ce que l’estimation est raisonnable ?

Premièrement, on ne veut qu’un ordre de grandeur, pas de nombres précis.

La plus simple bactérie comporte 600 gènes environ. Disons que chacun d’eux codent pour une protéine qui accomplie une fonction utile (donc 600 protéines différentes possibles dans cet organisme). Pour qu’une nouvelle protéine puissent être utile dans le lot des réactions biochimiques qui ont déjà lieu dans la bactérie, sa *propriété chimique* doit être « utile ». Elle doit catalyser une réaction ou y être impliqué d’une quelconque façon qui améliore ou provoque une fonction nouvelle. Or, les protéines ne réagissent pas avec n’importe quel autre type de molécule. Il y a une limite au nombre de molécules quelconque avec lesquelles une protéine peut réagir. On est d’accord jusque là ?

Disons que pour une protéine, il y a 100 milliards d’autres protéines avec lesquelles elle peut réagir (notons qu’une infime partie seulement serait utile*, disons 1 milliard). Donc, cette bactérie offrirait une possibilités de 600 x 1 000 000 000 = 600 milliards de séquences qui peuvent réagir avec une des 600 protéines déjà présente (6E11).

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Qu’est-ce qu’il y a de problématique là ? Où est l’estimation irraisonnable ? Les protéines sont des enzymes. Leur fonction dans l’organisme est souvent de se lier à un substrat spécifique ou d’interagir avec d’autres protéines pour former des complexes enzymatiques. Leur propriété chimique et donc leur fonction, est limité dans l’organisme parce qu’une seule protéine spécifique ne peut pas se lier à une multitude de substrats.

Puisqu’il y a une quantité limitée de substrats et de protéines déjà présente dans la bactérie, le nombre de protéine différentes qui peuvent s’avérer « utiles » dans l’organisme est nécessairement limité et mon estimation est plus que raisonnable.

Ceci dit, donnez qqchose de concret pour contrer ces deux points fondamentaux de mon calcul ou sinon, abstenez vous, parce que le reste n’est que radotage inutile.


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